Zur Erzielung einer größtmöglichen Sicherheit, wurden bei der Funktions-, Ausfall- und Gerätesicherheit hochwertige Komponenten, wirksame Kontrollmechanismen und viele innovative Detaillösungen realisiert.
Ein direkt wirkender Hauptschalter ist bei allen Bonex Scootern vorgesehen. Dieser kann jederzeit betätigt werden und der Antrieb schaltet in jeder Betriebssituation sofort ab. Ein Sanftanlauf erhöht die Bediensicherheit, da kein ruckartiges Anfahren auftritt. Beim Anfahren wird für eine Übergangszeit die Stromzufuhr erhöht, dadurch ist kurzfristig mehr Schub abrufbar. Diese Boostfunktion kann auch während der Fahrt aktiviert werden und dient zum Durchfahren von Engstellen mit erhöhter Strömung oder beim Anfahren mit hohen Lasten. Sollte ein Gegenstand in den Propeller geraten, schaltet umgehend der Motor ab. Die Ursache kann gefahrlos beseitigt werden und die Fahrt erneut aufgenommen werden. Diese Abschaltung schützt sowohl den Bediener, als auch eingebrachte Gegenstände und das Antriebsaggregat des Scooters.
Alle Bauteile im Bonex Scooter sind wasserdicht ausgeführt, die elektronische Komponenten wurden dazu zusätzlich gekapselt. Der Bonex Scooter hält seinen betriebsfähigen Zustand, selbst wenn ein etwaiger Wassereinbruch vorliegt, aufrecht. Zusätzlich ist ein Notfahrbetrieb möglich der auf einen zweiten autarken Steuerkreis zurückgreift.
Um die Funktion des Scooters dauerhaft sicher zu stellen, werden die Motorparameter und der Akku überwacht. Neben der Spitzenleistung, wird auch die Temperatur des Antriebes kontrolliert. Falls voreingestellte Grenzwerte überschritten werden, schaltet der Antrieb ab. Durch einfaches Aus- und wiedereinschalten wird diese Funktion wieder zurückgesetzt und der Scooter ist wieder betriebsbereit.